一個人有23對（46條）染色體，同一對染色體同一位置上的一對基因稱為等位基因，一般一個來自父親，一個來自母親。如果檢測到某個DNA位點的等位基因，一個與母親相同，另一個就應(yīng)與父親相同，否則就存在疑問了。

利用DNA進行親子鑒定，只要作十幾至幾十個DNA位點作檢測，如果全部一樣，就可以確定親子關(guān)系，如果有3個以上的位點不同，則可排除親子關(guān)系，有一兩個位點不同，則應(yīng)考慮基因突變的可能，加做一些位點的檢測進行辨別。DNA親子鑒定，否定親子關(guān)系的準(zhǔn)確率幾近100%，肯定親子關(guān)系的準(zhǔn)確率可達到99.99%。

DNA親子鑒定主要通過以下特征來判定

體細胞穩(wěn)定性：同一個體的血液、唾液、精液以及各器官組織DNA是一致的，并且對同一健康人來說是終生不變的，這是最基本的前提。

個體高度特異性：不同個體DNA 分子水平上遺傳本質(zhì)的差異，決定了同一種限制酶消化基因組DNA ，某一個體與另一個體的等位基因片段在數(shù)量和長度上是不可能相同的，從而產(chǎn)生具有個體特異性的DNA 。

按孟德爾遺傳規(guī)律遺傳：通過大量的家系調(diào)查證明，子代DNA 中所有等位基因帶都可以在雙親的DNA中找到，片段的傳遞符合孟德爾遺傳規(guī)律。